不論是自住裝修、建案開發還是工商廠房整建，工程完工後除了驗收確認品質，「何時能拿到合格證」、「合格證核發會不會影響尾款支付」，都是業主與承包廠商相當關心的問題，以下就針對合格證取得時程與對尾款的影響做完整說明。
合格證的核發時程會依工程類型、規模不同有很大差異，大致可以分成兩大類狀況：
如果是一般民間的小型室內裝修、局部修繕工程，只要完工後驗收符合合約規範，沒有不符合法規的狀況，大約3至7個工作天就能取得廠商核發或是報備主管機關的合格證明。
若是政府管轄的大型建案、新建房屋或是變更使用執照的工程，因為需要經過建管、消防、水電、環保等多個單位會勘審核，從完工送件到拿到合格證，大約需要1至3個月的時間，若是碰到公文流量大或是需要補件的狀況，時程還會再延長。
不論是業主自驗還是主管機關官方驗收，只要查出結構安全、消防設備、水電配置等不符合規範的缺失，都必須完成整改後才能取得合格證，缺失越多、整改難度越高，就會越晚拿到合格證。
申請官方核發合格證時，必須備妥工程圖說、材料證明、承商資格等眾多文件，若是文件準備不齊全或是內容有誤，就需要花費時間補件，直接拉長整體審核時程。
除了先前提到的小型裝修與大型建案的差異，不同屬性的工程審核單位不同，也會影響作業時間，像是涉及公共安全的消防、結構工程，審核標準嚴格，時程也會比一般裝修來得長。
大部分工程合約都會將「取得合格證」列為尾款支付的必要條件，主要原因是合格證代表工程已經符合法規與合約要求，業主可以透過這個條件保障自身權益，確保工程品質沒有問題後再結清款項。
常見的合約約定模式主要有兩種：一種是完工初驗無誤後先給付九成工程款，拿到合格證後再給付剩餘10%左右的尾款；另一種則是約定完工取得合格證後才結清所有未付帳款。不論是哪種模式，合格證核發的時間都會直接影響尾款支付的時間點，若是合格證延遲取得，廠商就必須延後拿到尾款。
想要避免合格證延遲影響後續尾款、交屋等時程，可以透過三個方式加快作業流程：
第一，提前熟悉主管機關的申請要求，在送件前就備齊所有文件，避免補件浪費時間；第二，完工前先由承包廠商自主檢查，提前整改可能的缺失，不要等到官方驗收才進行修正；第三，選擇熟悉當地法規與審核流程的合格廠商，能有效減少出錯機率，加快整體審核速度。
整體來說，完工後拿到合格證的時間從數天到三個月都有可能，簽訂工程合約時，建議業主與廠商雙方都要明確寫清楚合格證取得的預計時程、尾款支付的條件，才能避免後續因為時間問題產生不必要的糾紛。