台北市南港與內湖科學園區是北台灣最重要的科技與產業聚集地，每年都有大量新創、成熟企業進駐。擁有廠辦空間後，大多會依照自身營運需求調整空間、進行裝修修改；不過身為統一規劃的產業特區，兩園區都有專屬的廠辦裝修規範，沒有提前瞭解遵守，很可能耽誤施工時程，甚至產生額外的罰鍰與改裝成本。
科學園區屬於專屬管理的產業特定區，管理單位必須維護全園區的整體環境品質、公共安全與營運秩序，因此針對廠辦裝修訂定比一般商業大樓更嚴謹的規範。如果企業任意施工，不僅可能影響建築結構安全、干擾鄰近企業營運，也可能破壞園區整體規劃，因此所有裝修工程都必須符合規範並通過審核才能動工。
幾乎所有廠辦裝修都禁止隨意改變建築外觀，包括外牆開關窗、招牌尺寸與安裝位置、陽台外推、外牆顏色變更等等，都是管理單位嚴格把關的項目。如果真有調整外觀的需求，必須提前提交完整設計圖說給管委會或是科學園區管理局審核，通過後才能動工。
南港、內湖科學園區的廠辦多做為辦公、研發或是少量生產使用，對於消防安全要求比一般商業空間更高。不論是消防灑水系配置、逃生門動線、隔間材料的防火等級，都必須符合園區特訂規範；如果需要更動內部水電管線，也必須提交管線配置圖，確認不會影響公共管線安全才能施工。
園區多數企業都是正常白天營運，因此對於裝修施工時間多半設有嚴格限制，多數規定僅能在夜間、非上班時段或是假日施工，若必須在上班日施作噪音工程，也必須提前申請並做好降噪防塵措施。另外施工過程中必須保護電梯、走廊等公共區域，避免工程汙染或是損壞，完工後也必須全數清運工程廢棄物，不得任意堆置在園區公共區域。
展開裝修工程前，必須提前7至14天向園區管理單位遞交裝修設計圖、施工廠商資訊、安全切結書等文件，繳交裝修保證金後，審查通過領取施工許可才能開工。完工後還必須申請竣工查驗，確認所有工程都符合規範後，才會歸還保證金，完成整體裝修程序。
不少企業初次進駐南港、內湖科學園區，容易忽略特區專屬的裝修規範，導致施工到一半才被要求停工調整，浪費不少時間與預算。建議不論是新進駐裝修或是舊廠辦翻修，都要先向管理單位取得完整規範，並選擇熟悉當地園區規定的裝修廠商規劃，就能順利通過審核，按時完工進駐。